Leis gu bheil Bhìoras Fruit Rugose Tomato Brown a ’toirt buaidh air lusan tomato agus piobar air feadh na cruinne, tha companaidhean sìol ag obair air a bhith a’ briodadh tomato a tha an aghaidh.
Bha goireasan beairteach ginteil agus genomic rim faighinn le luchd-briodaidh tomato eadhon mus do thòisich na pròiseactan seicheamh genomic tomato. Chaidh cruinneachaidhean mòra germplasm tomato a stèidheachadh o chionn fhada ann an grunn àiteachan. Tha còrr air 75,000 inntrigeadh tomato air an gleidheadh ann am bancaichean gine air feadh an t-saoghail. Is e aon den fheadhainn as motha banca gine USDA aig Geneva, NY.
Chaidh òrdugh an genoma tomato a thòiseachadh ann an 2005 mar oidhirp ioma-nàiseanta eadar 14 dùthaich agus chaidh a chrìochnachadh ann an 2012. Chaidh na h-oidhirpean sin a luathachadh gu mòr le bhith a ’cleachdadh innleachdas fuadain, ionnsachadh innealan agus algorithms adhartach gus mion-sgrùdadh a dhèanamh air meudan mòra de dhàta ginteil agus phenotypic.
Pan-genoma tomato
Chruthaich luchd-rannsachaidh bho Institiùd Boyce Thompson ann an 2020 genome iomraidh àrd-inbhe airson tomato fiadhaich gus pan-genome tomato nas coileanta agus feumail a thoirt gu buil. Lorg iad earrannan den genoma a tha mar bhunait blas blas, meud agus aibidh, fulangas cuideam agus strì an aghaidh ghalaran. Taing gu ìre do theicneòlasan sreathan ùr-nodha as urrainn pìosan fada de DNA a leughadh, tha an genoma iomraidh nas coileanta agus nas ceart na an stòr-dàta a th ’ann.
Bidh seann theicneòlasan seicheachaidh a leugh pìosan nas giorra de DNA a ’comharrachadh mùthaidhean aig ìre aon-bhunait. Ach, chan eil iad math air a bhith a ’lorg atharrachaidhean structarail leithid cuir a-steach, cuir às, tionndadh no dùblachadh cnapan mòra de DNA.
Ann an 2019, thog buidheann eadar-nàiseanta de luchd-rannsachaidh pan-genome tomato a ’cleachdadh sreathan genome bho 725 seòrsachan riochdachail phylogenetically agus cruinn-eòlasach. Tha an stòr-dàta seo a ’toirt a-steach 4,873 gine nach deach a lorg anns an genoma iomraidh tùsail. Nochd mion-sgrùdaidhean caochlaideachd gnàthach / neo-làthaireach call mòr gine agus taghadh mòr àicheil de ghinean agus luchd-adhartachaidh aig àm dachaigheil agus leasachadh tomato.
Leugh an artaigil iomlan aig www.seedworld.com.